防爆風淋室在安裝完并驗收完畢后，也就可以正式使用了。一般要求，人員或貨物進入風淋室后，最好能舉起手臂，并轉動身體，然后不停地拍打全身的衣服，停留規定的時間后，才可以出防爆風淋室。上面的這些動作要求，全部是為了保證達到最好的除塵效果，但在實際使用時，很少有人做到，即使是在風淋室內增設了語音提示功能后，也不能保證。另外，根據不同控制方式，防爆風淋室的使用也有所不同。其實如此看來，防爆風淋室和一般的風淋室也并無兩樣。
對于手動吹淋防爆風淋室，員工進入風淋室，待前后門關閉后，用手啟動風機開關，開始吹淋，達到規定的時間后，出風淋室。素質不高的員工，進入這種風淋事后，會直接出風淋室，根本不會接受吹淋。所以這種形式的風淋室目前比較少見了。
目前最常見的就是自動聯鎖感應吹淋風淋室了，這種風淋室的前后門是聯鎖的，并在室內裝有感應開關。當員工進入風淋室后，進口門關閉，感應開關感應到人員的存在，這時前后門同時鎖住，風機開始工作，達到規定的吹淋時間后，出口門才會打開，人員才能出風淋室。這種風淋室對進入其內部的人員有強制吹淋作用，保證了一定的吹淋效果。而當人員通過風淋室離開潔凈間時，前后門鎖及感應開關會根據被打開的先后順序來決定是否需要吹淋，避免無效動作。
還有一種風淋室的進出口門配備了自動門，能感應到人員到來，自動開門。門的式樣和現在一些商場或公共場所的自動門相似。這種風淋室比較適用于食品、化妝品、醫藥等行業，可以防止由于手接觸門把手時，產生交叉感染。同樣，這種風淋室通常也具有強制吹淋的功能，除非風淋室的通道特別長，人員通過所需的時間完全超過風淋所規定的時間。
具有強制吹淋的防爆風淋室，當人員在風淋室內被吹淋時，兩門均被鎖，不能進出。這對人員較多，且進出比較頻繁時，通常會在風淋室旁或別的出口處單獨設置一處隔離室，用于人員離開潔凈間，以提高風淋室的利用率，減少不必要的等待。
防爆風淋室使用時應該經常觀測壓差表的變化，如果太差小于200帕時，要經常注意對初高效器的更換，以免灰塵堵塞而影響防爆風淋室的性能。
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